Брат е на Карл Вилхелм Ернст (1767 – 1781), граф на Изенбург-Бюдинген. Сестра му Амалия Луиза (1764 – 1844) се омъжва на 10 април 1786 г. в Реда за граф Лудвиг Хайнрих Адолф фон Липе-Детмолд (1732 – 1800), син на граф Симон Хайнрих Адолф фон Липе-Детмолд. Сестра му Филипина Хенриета Вилхелмина (1772 – 1834) се омъжва на 13 юли 1789 г. в Лемго за граф Мориц Казимир III фон Бентхайм-Текленбург (1764 – 1806), син на граф Мориц Казимир II фон Бентхайм-Текленбург.
Хайнрих Фердинанд умира на 27 декември 1838 г. във Вехтерсбах, Хесен-Дармщат, на 68 години, и е погребан във Филипсайх.
Георг Казимир Фридрих Лудвиг (1794 – 1875), граф на Изенбург-Бюдинген-Филипсайх, женен на 10 януари 1841 г. в Меерхолц за графиня Берта фон Изенбург-Бюдинген-Меерхолц (1821 – 1875)
Карл Лудвиг Хайнрих Ернст (1796 – 1863)
Фолрат Фридрих (1800 – 1864), граф на Изенбург-Бюдинген-Филипсайх, женен на 30 септември 1828 г. (развод 1851) във Вертхайм за принцеса Малвина фон Льовенщайн-Вертхайм-Фройденберг (1808 – 1879)
Klaus-Peter Decker: Grafschaft Isenburg-Büdingen. In: Ritter, Grafen und Fürsten – weltliche Herrschaften im hessischen Raum ca. 900 – 1806. Marburg 2014, ISBN 978-3-942225-17-5 (= Handbuch der hessischen Geschichte 3 = Veröffentlichungen der Historischen Kommission für Hessen 63), S. 232 – 272.
Genealogisches Handbuch des Adels. Adelslexikon Band XIII, Band 128. Starke, Limburg (Lahn) 2002, ISSN 0435 – 2408.
Bernd Müller: Das Fürstentum Isenburg im Rheinischen Bund – Vom Territorium zum Staat, Büdingen (Fürstlich Isenburg und Büdingische Rentkammer) 1978, 271 Seiten