Първия си по-значителен успех във вътрешния шампионат „шахматистите“ постигат през сезон 1975 – 76 под ръководството на Жозе Мария Педрото, като завършват втори. През 1998 – 99 г. повтарят успеха си и отново се окичват със сребърните медали. Накрая, през 2000 – 01 Боавища печели Португалската лига, като шампионът е определен едва в последния кръг от първенството. На 18 май2001 г. Боавища побеждава като гост Авеш с 0:3 и запазва преднината си от една точка в крайното класиране пред градския си съперник – Порто. През следващия сезон не успява да защити титлата си и завършва втори, на пет точки разлика след новия шампион – Спортинг Лисабон.
Клубът има 2 участия и в Шампионската лига, като през 1999 г. се представя повече от скромно, но при второто си участие през 2001 г. сътворява истинска сензация, финиширайки на второ място след Ливърпул и пред Борусия Дортмунд и Динамо Киев. Във втората фаза от турнира „шахматистите“ срещат предизвикателства като Манчестър Юнайтед и Байерн Мюнхен. Завършват на трето място в групата след победа и равен от двубоите си с френскияНант, и реми с немския колос. Треньор на отбора по това време е Хайме Пачеко. От клуба за големия футбол са тръгнали звезди като Петит, Нуно Гомеш и Жоао Пинто.
През сезон 2007 – 08 Боавища завършва на 9-о място в крайното класиране, но е изхвърлен от елита заради разразилият се корупционен скандал, засегнал водещите португалски клубове.[1]