Елизабет се омъжва на 10 април 1502 г. в Стендал за 18-годишния курфюрст Йоахим I Нестор фон Бранденбург (1484 – 1535) от род Хоенцолерн. През 1506 г. Йоахим основава първия бранденбургски университетAlma Mater Viadrina във Франкфурт на Одер.
Около 1523 г. тя се присъединява към учението на Мартин Лутер и нейният съпруг я заплашва да я затвори. През 1527 г. тя тайно получава причастие и бяга през март 1528 г. в Торгау при чичо си по майчина линия курфюрст Йохан Саксонски и остава в неговия двор до 1535 г. Страда от липса на пари. Положението ѝ се подобрява след смъртта на нейния съпруг през 1535 г., след което синовете ѝ Йоахим и Йохан ѝ дават добра годишна рента. След това тя живее девет години в дворец Лихтенбург при Претин. През 1545 г. тя се връща в Марк Бранденбург.