След смъртта на баща му той поема управлението заедно с братята си Карл († 1561) и Йоахим Ернст († 1586), под опекунството на техния чичо Георг III († 1553) и Йоахим I († 1561).
През 1553 г. братята наследяват Анхалт-Пльотцкау от чичо им Георг III. По-късно Бернхард управлява в Десау, Йоахим Ернст в Рослау, a Карл в Цербст. След смъртта на чичо им и отказа на братовчед им Волфганг фон Анхалт-Кьотен братята Йоахим Ернст и Бернхард получават през 1562 г. цялата земя Анхалт. През 1563 г. братята си разделят земята.
Бернхард умира през 1570 г. Брат му Йоахим Ернст получава неговите територии и обединява цял Анхалт.