Той е вторият син на крал Фердинанд I (1424 – 1494) и първата му съпруга Изабела дьо Клермон (1424 – 1465), дъщеря на граф Тристан от Капертино и Катерина Орсини. Брат е на Алфонсо II и чичо на Фернандо II.
На 44 години Федерико I последва на трона бездетния си племенник Фернандо II, който умира през 1496 г.
През 1501 г. братовчед му, испанския крал Фернандо II Католикът, окупира Неаполитанското кралство. Федерико I се съюзява с френския крал Луи XII, предава му се и му оставя правата над кралството.
Федерико I умира през 1504 г. в Тур. Крал на Неапол става Фернандо II Католика.
Карлота (1480 – 1506) ∞ 1500 Гуидо XV, граф на Лавал (1476 – 1531)
Втори брак: на 28 ноември 1486 г. в Андрия с Изабела дел Балцо (24 юни 1468 – 22 май 1533), дъщеря на Пиро дел Балцо, херцог на Андрия и княз на Алтамура, и на Мария Доната дел Балцо Орсини. С нея той има пет деца:
Gino Benzoni: Federico d'Aragona. In: Fiorella Bartoccini: Dizionario Biografico degli Italiani (DBI). Band 45 (Farinacci–Fedrigo), Istituto della Enciclopedia Italiana, Rom 1995, S. 668 – 682.