Образува се през 1680 г. чрез наследствена подялба между седемте сина на херцог Ернст I „Благочестиви“ от Саксония-Гота († 26 март 1675) от Ернестинската линия на род Ветини. Херцогството Саксония-Айзенберг е дадено на петия му син Християн.
От 1680 до 1692 г. тамошният замък е преустроен на барок-дворецаХристианов замък. Построява се дворцова църква, която е най-красивата барок-църква на Тюрингия. Със смъртта на бездетния херцог Християн през 1707 г. херцогството престава да съществува и попада към Саксония-Гота-Алтенбург.