От 1963 г. до 1969 г. работи като биолог в Института по зоология към Българска академия на науките. През 1967 г. специализира биоспелеология във Франция, а през 1970 г. паразитология в Прага[1]. От 1969 г. до 1978 г. е научен сътрудник в Института по зоология при БАН. Доктор по зоология е от 1975 г. През 1978 г. е избран за доцент в същия институт и завеждащ секция „Зоология“ в Националния природонаучен музей при БАН.[2]
Ръководител и участник в много експедиции и самостоятелни пътувания в повече от 80 страни в Европа, Азия, Африка, Северна и Южна Америка, Нова Гвинея. Изкачва множество върхове в Андите, Хималаите, Алпите, Килиманджаро, Камерун, както и в планините в Турция и Иран. През 1967 г. посещава островите Сицилия и Крит, пише книга за пещерната фауна на остров Корсика. Участва в спускането в една от най-дълбоките пропасти в света – Берже във Франция през 1969 г. През 1971 г. пътува с мотоциклет из Турция, а през 1972 г. прави обиколка на Турция, Иран, Ирак, Сирия и Ливан. В 1974 г. пътува с мотоциклет из Гърция и посещава пещери на остров Крит. През 1975 г. участва в Британска спелеологична експедиция в Нова Гвинея и в Англия.
В продължение на 3 години (1976 – 1979 г.) работи като управител на резервати в щата Плато Нигерия. Пътува из Камерун, Бенин, Того, Екваториална Гвинея, Заир – плава 1700 km по река Конго, Сенегал и Египет. През 1979 г. посещава Бразилия, Перу и Боливия. В 1980 г. пътува из остров Сардиния и Федерална република Германия. През 1981 г. е ръководител на спелеологична експедиция в Куба, пътува в Непал и Ладак. В 1982 г. посещава Куба, Мексико, Южна Корея и Гърция. Ръководител е на българска експедиция в Мозамбик, Зимбабве, Замбия и Танзания през 1983 г. Прави и проучвания в Гърция. През 1984 г. е научен ръководител на експедиция в Непал, Бирма, Тайланд, Индия и Шри Ланка. Участва в IX световен конгрес по спелеология в Испания през 1985 г. Прави проучвания в Афганистан. През 1987 г. е командирован в Китай и КНДР, прави изследвания на гръцки острови и участва в експедицията „Ама Даблам“ в Непал.
От 1993 до 2005 г. е директор на Националния природонаучен музей при БАН. Преподава зоогеография в Биологическия факултет на Софийския университет „Св. Климент Охридски“ и акарология в Пловдивския университет „Паисий Хилендарски“.
Д-р Петър Берон е изявен обществен деятел в България и в световен мащаб.
От 1985 г. е председател на Българската федерация по спелеология.
Участва в ръководството на множество международни организации.
Изследванията на ст.н.с. д-р Петър Берон са най-често насочени към пещерната фауна, фауната (предимно акари) на високите планини в света, към прилепите и техните ектопаразити, към историята на зоологията. П. Берон ползва руски, английски и френски език. Автор е на голям брой научни и публицистични трудове.
Политическа кариера
Д-р Берон влиза в политическия живот на страната като един от основателите на Независимо сдружение „Екогласност“. Дейността му като политик е разнообразна и свързана с различни формации:
На президентските избори през януари 1992 г. е кандидат за вицепрезидент като подгласник на Жорж Ганчев. Оттогава датира крилатата фраза „Кажи си приказката, Бероне!“. Двойката събира 16,78% от гласовете и остава на трето място.
Избран е за заместник-председател на XL народно събрание.
Напуска парламентарната група на коалиция „Атака“ на 3 октомври2006 г.[4]
На президентските избори на 22 октомври 2006 г. е издигнат от инициативен комитет за кандидат-президент. Събира по-малко от 1% от гласовете.
Скандали
Агент на ДС
През 2006 г. бившият президент Желю Желев казва, че е чел досието от Държавна сигурност на Берон, включително негови доноси, къде се събира „Екогласност“, какви инициативи има, кой какво е казал. Според Желев някой е излъгал Берон, че досието му е унищожено, но и той не знае къде се намира това досие. Петър Берон категорично отрича да е бил агент на ДС.[5]
През 2007 година се установява, че Петър Берон е сътрудник и осведомител на Шесто управление на Държавна сигурност от 1969 година. През 1990 година е издадено искане за заличаване на част от данните за него в архива.[6]