На 29 август 1556 г. 14-годишният Йохан Фридрих е избран за светски епископ на Каминското епископство и встъпва на тази длъжност на 15 юни 1557 г. От 1558 до 1560 г. той учи с братята си Ернст Лудвиг и Богислав XIII в университета в Грайфсвалд, където през 1558 г. той е ректор.
През 1560 г. Йохан Фридрих наследява баща си като херцог на Померания във Волгаст. През 1569 г. той е херцог на Померания в Щетин под регентството на майка му и чичо му Барним IX. През 1565 г. започва служба при император Максимилиан II във Виена, участва във войната против турците. На 8 ноември 1567 г. поема управлението в Померания-Волгаст заедно с брат му Богислав XIII.
Martin Wehrmann: Geschichte Pommerns. Bd. 2, Friedrich Andreas Perthes, Gotha 1921 (Reprint: Weltbild Verlag, Augsburg 1992, ISBN 3-89350-112-6) S. 61 – 87.