لعب ماركو ريمر خلال مسيرته الاحترافية مع 5 أندية في ثمانية عشر موسمًا وسجل خلالها 26 هدفًا ضمن 318 مباراة. ولم يفز بأي موسم بالكأس أو بالدوري.
خاض ماركو ريمر مسيرته مع نادي يونيون برلين في موسم 1990–91 ليلعب معه سبعة مواسم، مشاركًا في 90 مباراة سجل خلالها 14 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي هانزا روستوك في موسم 1996–97 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، حيث شارك في 81 مباراة سجل خلالها 4 أهداف. لينتقل بعدها إلى SG Gesundbrunnen Berlin [الإنجليزية] في موسم 1999–00 ليلعب معه خمسة مواسم، مشاركًا في 107 مباراة سجل خلالها 6 أهداف. ثم انتقل إلى Hertha BSC II [الإنجليزية] في موسم 2004–05 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 3 مباريات ولم يسجل أي هدف. هذا وانتقل لاحقًا إلى نادي آينتراخت فرانكفورت في موسم 2005–06 ولمدة موسمين، مشاركًا في 37 مباراة سجل خلالها هدفين.[4]