Watokobu merupakan salah satu desa yang ada di kecamatan Nubatukan, kabupaten Lembata, provinsi Nusa Tenggara Timur, Indonesia. Desa ini merupakan satu dari 14 desa dan kelurahan yang berada di kecamatan Nubatukan. Desa ini memiliki kodepos 86684.
Desa ini memiliki jumlah penduduknya sebagian besar bersuku daerah Flores. Sebagian besar penduduknya bermatapencaharian petani. Hasil pertanian utama di desa ini ialah kemiri, kopi, kakao, kelapa, jagung dll.
Pranala luar