MM 38是全系列當中第一款服役的飛彈,以2000年公佈的數字,一共生產1332枚,其中只有154枚是法國海軍所訂購。絕大多數未改良的MM 38已經超過產品有效期限,英國皇家海軍購置之飛魚飛彈均已除役,法國和大部分南美洲國家用戶陸續更換火箭發動機,法國本身還將飛彈的電子系統提升到與MM 40第二批次接近的等級。根據廠商報價,更換火箭發動機的費用是9萬美元/枚,可以延長至少10年壽命。
第三批次(Block 3)是2004年2月法國武器裝備總局(英语:Direction générale de l'armement)委託MBDA研發的飛魚飛彈,主要目的是取代ANS飛彈計畫取消之後的戰力空檔,也繼續為飛魚飛彈在國際市場上維持競爭力。第三批次最大的改變是將火箭發動機更換為TRI-40發動機,發動機進氣來源在主翼後部的4個小進氣口,更換動力後的飛魚block3最大射程超過180公里,其他改良的部分還包含新型J波段尋標器,雷射陀螺儀、新型慣性導引系統,更換推進段後飛魚飛彈仍維持原先尺寸,但重量略微提升(740公斤),但不需要作改造仍可在既有的飛魚飛彈發射架上裝設。
第三批次在2007年4月25日在勒旺島(英语:Île du Levant)海域測試場完成最終測試,2008年10月開始量產。首張訂單是法國海軍在2008年12月簽訂,由45枚第二批次飛彈升級,配備在地平線級巡防艦上,在2011年後決定再升級80枚第二批次飛彈;目前有希臘、阿拉伯聯合大公國、智利、祕魯、卡達、阿曼、印尼、摩洛哥等國採購第三批次飛魚飛彈。巴西海軍採購的MM40則是配備MBDA與Avibras公司(英语:Avibras)合作研製的發動機,該改良型在2012年完成測試。
英國海軍也曾經使用過飛魚飛彈,其中最後幾艘配備此型飛彈的船艦之一的拳師級巡防艦(Boxer class frigate,又稱為Batch 2 Type 22 / 22型第二批巡防艦)——雪菲爾號(HMS Sheffield F 96)與它的姊妹艦科芬特里號(HMS Coventry F 98),就是以當年在福島戰爭中被擊沈的兩艘42型驅逐艦為名以茲追憶。這兩艘巡防艦已在2002年時除役並分別出售給智利與羅馬尼亞,成為威廉海軍上將號(Almirante Williams FFG19)與斐迪南國王號(Regele Ferdinand),但早在兩艘軍艦除役前的1997年10月時,英國皇家海軍就已經陸續開始停用艦隊中的飛魚飛彈,並在1999年時正式完全停用。雖然當時因為兩艘軍艦已經屆服役年限,因此英國軍方並未將兩艦艦首的四具單發型MM 38飛魚飛彈發射器拆除換裝他型武器系統,但在其他較新的英軍軍艦上,停用的飛魚系統大多是由較新銳的魚叉反艦飛彈(Harpoon SSM)系統所取代。
^John, Nott, Here Today, Gone Tomorrow, 2002, (原始内容存档于2010-11-22), A remarkable world-wide operation then ensured to prevent further Exocets being bought by Argentina. I authorised our agents to pose as bona fide purchasers of equipment on the international market, ensuring that we outbid the Argentineans. Other agents identified Exocet missiles in various markets and covertly rendered them inoperable, based on information from the French. (John Nott, defence minister during the Falklands war) (页面存档备份,存于互联网档案馆)