1999年日本羽球公開賽,為第18屆日本羽球公開賽,於1999年4月6日至11在日本東京都代代木第二體育館舉行,總奬金18萬美元。
本屆賽事五個項目中,有兩個項目衛冕成功,分別是男子單打的丹麥選手彼得·蓋德、女子雙打的中國組合葛菲/顧俊,其中後者是三連霸。