臺灣基督長老教會旗後教會位於臺灣高雄市旗津區,是臺灣基督長老教會高雄中會所轄的教會之一。
清同治四年(1865年),英國長老教會海外宣道會宣教師馬雅各來臺宣教傳道,從打狗港上岸後,便前往臺南府城看西街租屋行醫傳道;然而當時府城居民普遍反對洋教,同年7月返回打狗,於通山街朝日鐵工廠處租一間店面傳道醫病。
隔年(1866年)6月於旗後山腰購地蓋醫館,是為長老會在臺灣本島的第一間禮拜堂,同時亦為紀念研究熱帶病症有熱帶醫學之父之稱的萬巴德醫生,醫館名為「慕德醫館」,是臺灣第一間西醫醫館。
同治六年(1866年)8月12日,甘為霖牧師替陳齊、陳清和、高長和陳圍四人受洗,並舉行聖餐禮拜,此後長老會宣教以旗後禮拜堂為根據地,向埤頭(鳳山)、阿里港(里港)、阿猴(屏東市)、東港等地傳福音,旗後教會成為南部宣教中心。
馬雅各牧師在旗後教會三年之後,再轉往臺南府城二老口(今北門路與衛民街一帶)做傳教的發展地,旗後教會就由李庥牧師負責;同時巴克禮牧師亦將宣教的中心遷移到臺南府城,教士會於大正五年(1916年)決議賣掉打狗醫館,以籌措台南新樓醫館的新工程經費,之後周瑞長老以日幣貳仟元分五年付款給教士會,購買奉獻給教會。
昭和十年(1935年),巴克禮牧師於旗後教會現址重建禮拜堂。由於舊禮拜堂多處老舊,空間不敷使用,遂於2010年拆除,三年後(2013年)新教堂竣工,高聳巍峨的旗後教會新禮拜堂成為旗津地區最顯著地標之一。 [1][2][3][4][5]
以下時間以當地時間(臺灣時間)為準[6]
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