林肯縣(英語:Lincoln County)是美国密蘇里州東部的一個縣,東隔密西西比河與伊利诺伊州相望,面積1,659平方公里。根據2020年美國人口普查,共有人口59,574人。縣治特洛伊。該縣成立於1818年12月14日,縣名紀念美國獨立戰爭將領本傑明·林肯(Benjamin Lincoln)。