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日本渡輪營運商列表是指在日本國內或國際之間，設有渡輪服務的營運商列表：

國內地域之間航線

商船三井集團

商船三井渡輪（日语：商船三井フェリー）
太陽光渡輪（日语：フェリーさんふらわあ）（舊:關西汽船（日语：関西汽船），鑽石渡輪（日语：ダイヤモンドフェリー））
名門大洋渡輪（日语：名門大洋フェリー）

SHK Line（日语：関光汽船）集團

新日本海渡輪（日语：新日本海フェリー）
阪九渡輪（日语：阪九フェリー）
OCEAN TRANS（日语：オーシャントランス）（舊:OCEAN東九渡輪（日语：オーシャン東九フェリー））

其他

各地域內航線與近距離航線

☆代表公司經營國道海上區間（日语：海上国道）的航線

◎代表公司擁有總噸數達1000噸的船

沖繩縣

座間味村營（座間味3渡輪）
渡嘉敷村營（渡嘉敷渡輪）
粟國村營（粟國渡輪）
久米商船（日语：久米商船）◎（琉球渡輪、海邦渡輪）
大東海運（日语：大東海運）（大東）
伊是名村營（伊是名尚圓渡輪）
伊平屋村營（伊平屋3渡輪）
伊江村營（伊江村營渡輪）
神谷觀光（久國渡輪）
久高海運（久國渡輪III）
多良間海運（日语：多良間海運）（Taramayu渡輪）
八重山觀光渡輪（日语：八重山観光フェリー）
安榮觀光（日语：安栄観光）
石垣島夢觀光（日语：石垣島ドリーム観光）（夢渡輪）
福山海運（與那國渡輪）

國際

SHK線（日语：関光汽船）集團

關釜渡輪（日语：関釜フェリー）（下関～釜山）
蘇州下關渡輪（日语：蘇州下関フェリー）（下関～太倉貨物航線）

JR九州高速船

博多港～釜山港 對馬市比田勝港/巖原港～釜山港

曾經存在的公司

日本國有鐵道（青函連絡船、宇高連絡船（日语：宇高連絡船）、仁堀連絡船（日语：仁堀連絡船）、大島連絡船（日语：大島連絡船）、關門連絡船（日语：関門連絡船）等鐵路渡輪）

- 當於橋粱與隧道開通（青函隧道、瀨戶大橋、大島大橋（日语：大島大橋 (愛媛県)）、關門鐵路隧道、關門行車隧道），以及與民間航線（吳·松山渡輪（日语：呉・松山フェリー））進行競爭因而廢止。

日本道路公團（厚岸渡輪（日语：厚岸フェリー）、鳴門渡輪（日语：鳴門フェリー）、明石渡輪（日语：明石フェリー）、國道九四渡輪（日语：国道九四フェリー）等四條航線）

- 厚岸渡輪因建設橋粱後廢止，其餘均轉讓事業。在轉讓事業後還繼續營運的航線只有國道九四渡輪。

長距離渡輪

近海郵船（日语：近海郵船物流）（東京至釧路）・・・在1999年10月，取消旅客服務，只餘下貨物運輸服務
日本沿海渡輪（日语：日本沿海フェリー）・・・改名為藍色公路線後，分割為商船三井渡輪（日语：商船三井フェリー）及藍色公路線西日本（日语：藍色公路線西日本）
日本高速渡輪（日语：日本高速フェリー）・・・1975年經歷經營危機後縮小規模，在1990年11月把最後營運的航線經營權轉讓給日本沿海渡輪，隨即公司解散。該航線截至2010年現時還在營業，為大阪～鹿兒島（志布志）航線（太陽花渡輪（日语：フェリーさんふらわあ））。而東京～那智勝浦～高知航線於2001年10月廢止
中央渡輪（日语：セントラルフェリー）（川崎 - 大阪、神戶航線）・・・由於沒有盈利，在1972年廢止
西日本渡輪（神戶 - 苅田航線）・・・由於沒有盈利，在1975年轉讓給阪九渡輪（日语：阪九フェリー）後隨即公司解散
廣島綠渡輪（日语：広島グリーンフェリー）（大阪 - 廣島航線）・・・由於沒有盈利，在1982年廢止
富士渡輪（東京 - 松阪航線）・・・由於沒有盈利，在1979年轉讓給九州急行渡輪（日语：九州急行フェリー）後隨即公司解散
日本汽車渡輪（日语：日本カーフェリー）・・・重組為Seacom渡輪（日语：シーコムフェリー）
宮崎汽車渡輪（日语：宮崎カーフェリー）（第一代）・・・被日本汽車渡輪（日语：日本カーフェリー）收購
Seacom渡輪（日语：シーコムフェリー）・・・重組為Marine Express（日语：マリンエキスプレス）
三寶海運（日语：三宝海運）（松山 - 神戶航線）・・・由於經營惡化結業
愛媛阪神渡輪（日语：愛媛阪神フェリー）（松山 - 神戶航線）・・・由於經營惡化結業
室戶汽船（日语：室戸汽船）
高知海線（日语：高知シーライン）（大阪南港（以前為東神戶渡輪中心（日语：東神戸フェリーセンター）） - 甲浦港（日语：甲浦港） - 足摺港）・・・由於經營惡化結業
大阪高知特急渡輪（日语：大阪高知特急フェリー）（大阪南港 - 高知港）・・・2005年6月30日起航線廢止
Marine Express（日语：マリンエキスプレス）・・・2005年12月破產。只有宮崎航線由宮崎汽車渡輪（日语：宮崎カーフェリー）繼續營運
名門汽車渡輪（日语：名門カーフェリー）・・・與大洋渡輪（日语：大洋フェリー）合併，成為名門大洋渡輪（日语：名門大洋フェリー）
照國郵船（日语：照国郵船）・・・改名為Marix Line（日语：マリックスライン）
海洋渡輪（日语：オーシャンフェリー）・・・與東九渡輪（日语：東九フェリー）合併，成為海洋東九渡輪（日语：オーシャン東九フェリー）
太平洋沿海渡輪（日语：太平洋沿海フェリー）・・・重組為太平洋渡輪（日语：太平洋フェリー）
大洋渡輪（日语：大洋フェリー）・・・與名門汽車渡輪（日语：名門カーフェリー）合併，成為名門大洋渡輪（日语：名門大洋フェリー）
東九渡輪（日语：東九フェリー）・・・與海洋渡輪（日语：オーシャンフェリー）合併，成為海洋東九渡輪（日语：オーシャン東九フェリー）
里維拉（日语：リベラ_(海運業)）・・・成為Blue Ocean 100%子公司。現時子公司還存在
東日本渡輪（日语：東日本フェリー）・・・在2003年申請公司更生法後，與里維拉合併，在2006年成為子公司，在2009年與Blue Ocean旗下的津輕海峽渡輪（日语：津軽海峡フェリー）合併。除了由津輕海峽渡輪承繼，由函館港為起點的航線外，其他航線全部廢止
九越渡輪（日语：東日本フェリー#九越フェリー）・・・被里維拉收購合併，於2006年航線暫停營運，在2008年航線廢止
大島運輸（日语：大島運輸）・・・改名為A-Line渡輪（日语：マルエーフェリー）
琉球海運（日语：琉球海運）・・・在2006年9月18日結束旅客運送事業
九州急行渡輪（日语：九州急行フェリー）・・・貨物專用。2007年6月1日與商船三井渡輪（日语：商船三井フェリー）合併
藍色公路線西日本（日语：ブルーハイウェイライン西日本）　2007年7月1日與鑽石渡輪（日语：ダイヤモンドフェリー）合併
穿梭公路線（日语：シャトル・ハイウェイライン）（橫須賀 - 大分航線）・・・在2007年9月3日自行申請破產，航線廢止
有村產業（日语：有村産業）・・・破產
海洋東九渡輪（日语：オーシャン東九フェリー）・・・與王子海運合併，成為OCEAN TRANS（日语：オーシャントランス）
關西汽船（日语：関西汽船）・・・與鑽石渡輪合併成為太陽花渡輪
鑽石渡輪（日语：ダイヤモンドフェリー）・・・與關西汽船合併，成為太陽花渡輪

中、短距離渡輪

廣別汽船（日语：広別汽船）
日本汽車渡輪（日语：日本カーフェリー）（→Marine Express（日语：マリンエキスプレス），川崎 - 木更津航線）・・・在東京灣跨海公路開通後廢止
大阪淡路線（日语：大阪淡路ライン）
共同汽船（日语：共同汽船）
南海德島穿梭線（日语：南海徳島シャトルライン）
臨空渡輪（泉佐野至德島航線）・・・航線沒有盈利
三原·今治國道渡輪（日语：三原・今治国道フェリー）
阪神繞道渡輪（日语：阪神バイパスフェリー）（東神戶 - 泉大津航線）・・・航線沒有盈利
兒坂汽船（兒島－坂出航線）・・・在瀨戶大橋建成後廢止
大三島渡輪（日语：大三島フェリー）（垂水 - 井口航線）・・・在多多羅大橋建成後廢止
中·四國渡輪（日语：中・四国フェリー）（竹原 - 波方）・・・2009年4月30日廢止，航線沒有盈利
吳·松山渡輪（日语：呉・松山フェリー）・・・2009年6月30日廢止，航線沒有盈利
防予汽船（日语：防予汽船）（柳井 - 開作，松山 - 伊保田 - 岩國航線）・・・大島大橋（日语：大島大橋 (山口県)）建成後廢止
中島町營汽船（日语：中島町営汽船）（松山 - 忽那諸島（日语：忽那諸島） - 吳、廣島。高速快艇）・・・出售並私有化（現時：中島汽船（日语：中島汽船））
宿毛觀光汽船（日语：宿毛フェリー）（宿毛 - 佐伯航線）・・・公司倒閉後由宿毛渡輪（日语：宿毛フェリー）承繼
德島阪神渡輪（日语：徳島阪神フェリー）（大阪南港、神戶 - 德島航線）・・・在明石海峽大橋建成後廢止
德島渡輪（深日（日语：深日） - 德島航線）
小松島渡輪（日语：小松島フェリー）（大阪南港 - 小松島）
淡路渡輪港（日语：淡路フェリーボート）（海港園 - 大磯航線、須磨 - 大磯航線、阿那賀 - 龜浦航線）・・・在大鳴門橋、明石海峽大橋建成後廢止
甲子園高速渡輪（日语：甲子園高速フェリー）（西宮 - 津名航線）・・・在明石海峽大橋建成後經營惡化而廢止
Bumper渡輪（日语：バンパックフェリー）（東神戶 - 川之江 - 新居濱航線）・・・在明石海峽大橋建成後，於1998年廢止
靜岡縣綜合管理公社（日语：希望 (高速フェリー)）（清水 - 下田航線）
大阪灣渡輪（日语：大阪湾フェリー）・・・在2000年，轉讓給南海淡路線（日语：南海淡路ライン）
南海淡路線（日语：南海淡路ライン）・・・在2007年航線暫時停運
舞鶴汽船（日语：舞鶴汽船）・・・在2004年航線廢止
福山·多度津渡輪（日语：福山・多度津フェリー）・・・2008年8月31日航線廢止
關門海峽渡輪（日语：関門海峡フェリー）（SHK Line（日语：関光汽船）集團）・・・2011年11月30日航線停運
大隅交通網絡（日语：大隅交通ネットワーク）・・・在2011年12月1日經營轉讓給垂水渡輪（日语：垂水フェリー）
明石淡路渡輪（日语：明石淡路フェリー）（章魚渡輪）☆◎・・・在2012年6月29日航線廢止
宇高國道渡輪（日语：宇高国道フェリー）（實際上由國道渡輪營運）☆・・・2012年10月17日航線暫停
疾風（日语：はやて (海運業)）・・・在伊良部大橋開通後，於2015年1月31日航路廢止
宮古渡輪（日语：宮古フェリー）・・・在伊良部大橋開通後，於2015年1月31日航路廢止

國際航線

奥林汽船（日语：オリエントフェリー） 2015年12月26日航線暫停

外部連結

日本長距離渡輪協會官網（页面存档备份，存于互联网档案馆）（日語）
日本旅客船協會（页面存档备份，存于互联网档案馆）（日語）

日本渡輪營運商列表

國內地域之間航線

各地域內航線與近距離航線

北海道地方

北海道・東北地方間

東北地方

關東地方

中部・北陸地方

東海地方

近畿地方

瀨戶內海

山陰地方

中國・九州地方之間

四國・九州地方之間

九州地方

沖繩縣

國際

曾經存在的公司

相關條目

外部連結

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