Cúp bóng đá châu Phi 1988 là Cúp bóng đá châu Phi lần thứ 16, được tổ chức tại Maroc, thay thế cho quốc gia đăng cai dự kiến là Zambia. Đây là lần đầu tiên Maroc đăng cai Cúp bóng đá châu Phi. Số đội tham dự giải là 36, nhiều hơn giải trước đó 2 đội. Thể thức thi đấu không đổi. Vòng chung kết gồm 8 đội chia làm 2 bảng, mỗi bảng 4 đội. Hai đội tuyển đứng đầu mỗi bảng vào đá bán kết, đội thắng ở bán kết vào đá chung kết, đội thua dự trận trận tranh giải ba. Cameroon lần thứ hai giành chức vô địch sau khi thắng Nigeria 1-0 ở chung kết. Còn Ai Cập trở thành đội đương kim vô địch thứ tám bị loại ngay từ vòng bảng (sau CHDC Congo là vào các năm 1970, 1976, Ghana là vào các năm 1980, 1984 cùng với Sudan 1972, Maroc 1978 và Nigeria 1982).
Vòng loại của giải gồm 34 đội tham gia, chọn lấy 6 đội cùng với đương kim vô địch Ai Cập và chủ nhà Maroc tham dự vòng chung kết. Vòng loại thi đấu theo thể thức loại trực tiếp sân nhà và sân khách, có áp dụng luật bàn thắng sân khách. Ở vòng sơ loại có 20 đội chọn lấy 10 đội thắng vào vòng loại thứ nhất. Ở vòng loại thứ nhất có 24 đội chia làm 12 cặp đấu để chọn 12 đội thắng vào vòng loại thứ hai. Vòng loại thứ hai 12 đội chia làm 6 cặp đấu, 6 đội thắng dự vòng chung kết.
Vòng chung kết của giải diễn ra trong 2 tuần từ 13 đến 27 tháng 3 năm 1988. Các trận đấu ở bảng A được tổ chức tại thành phố Casablanca, ở bảng B được tổ chức tại thủ đô Rabat.
