Nội dung cốt truyện cũng tương tự bản Army Men: Sarge's Heroes kể về viên Tướng Plastro và đội quân phe Tan của hắn đã tiến hành hành chinh phục thế giới nhựa và thế là Sarge và cô bạn gái phóng viên Vikki lên đường quyết ngăn chặn âm mưu này. Xuyên suốt game, người chơi sẽ phải thực hiện nhiều nhiệm vụ khác nhau như giải cứu đồng đội, thâm nhập vào căn cứ địch, trốn khỏi nhà tù, điều tra tình hình địch và lấy cắp thiết bị thông tin liên lạc. Người chơi có thể chọn một trong hai nhân vật chính tham gia cuộc hành trình này là Sarge hoặc Vikki, nhưng nhiệm vụ cho từng người đều giống hệt nhau và một khi đã chọn nhân vật nào thì không thể đổi lại được trừ khi người chơi muốn chơi lại từ đầu game.
