Чемпіонат Мальти з футболу 1998—1999 — 84-й сезон чемпіонату Мальти з футболу. Титул втретє поспіль здобула Валетта.
|} Примітки: 1. Клуб Біркіркара взяв участь у Кубку УЄФА 1999—2000 як фіналіст Кубка Мальти 1998—1999.
Позначення:
Lokasi Pengunjung: 18.118.227.90