Управління Імператорського двору Японії засноване 1949 року. Його попередниками були Міністерство Імператорського двору, що діяло протягом 1869–1947 років, та Адміністрація Імператорського двору[3], що працювала протягом 1947–1949 років[2].
Голова Управління призначається прем'єр-міністр Японії, а затверджується Імператором. Голові допомагає один заступник, який координує роботу усіх структур та інспектує їх, і секретар, який за наказом голови виконує секретні доручення[2].
Управління також контролює Імператорські комори і пасовиська. В Кіото знаходиться регіональна філія Управління, що займається майновими справами Імператорського дому у Західній Японії[2].