У дорослому футболі дебютував 1996 року виступами за команду клубу «Осасуна Б», в якій провів два сезони, взявши участь у 27 матчах чемпіонату.
Своєю грою за дубль привернув увагу представників тренерського штабу основного клубу «Осасуна», до складу якої приєднався 1997 року. Відіграв за клуб з Памплони наступні три сезони своєї ігрової кар'єри. Більшість часу, проведеного у складі «Осасуни», був основним гравцем команди.
2000 року уклав контракт з клубом «Атлетик», у складі якого провів наступні одинадцять років своєї кар'єри гравця. Граючи у складі «Атлетика» також здебільшого виходив на поле в основному складі команди.
В кінці серпня 2011 року Пабло був відданий в оренду в «Олімпіакос» до кінця сезону. Після завершення оренди повернувся до Більбао, але оскільки до планів керівництва не входив, отримав статус вільного агента.
2012 року уклав однорічний контракт з російським клубом «Рубін» (Казань). По завершенні цього контракту повернувся на батьківщину, де продовжив виступати на полі за нижчолігову команду «Валлє Егуес».
