Матіас Абальдо є вихованцем футбольної академії столичного клубу «Дефенсор Спортінг». 4 грудня 2021 року Абальдо дебютував на професійному рівні в основі «Дефенсора».[1] У 2022 році разом з клубом виграв перший в історії розіграш Кубку Уругваю.[2]
У серпні 2023 року футболіст відправився до Аргентини, де продовжив свою кар'єру, граючи в оренді у клубі Прімери«Хімнасія і Есгріма».[3]
