Опублікувала численні наукові роботи на теми: оцінка пріоритетних сфер збереження; біогеографія неотропних ссавців; цитостаксономія; збереження ссавцівАмазонки; опіка колекцій та баз даних; населення та екологія ссавців в Амазонці, генетика ссавців Амазонки; примати Амазонки та систематика неотропних ссавців з молекулярною систематикою та систематичною еволюцією, філогенією, біогеографією.[1]
Описані види
Марія да Сілва описала такі види (деякі у співавторстві):