Із 1940 року в армії. Пройшов шлях від рядового розвідника до начальника розвідки дивізії. У роки війни воював на Південно-Західному, Білоруському фронтах[1].
Відзначився 26 вересня 1943 року Ковтун на чолі розвідгрупи переправився через Дніпро в районі села Глушець Лоєвського району Гомельської області Білоруської РСР і пробрався у ворожий тил, де провів розвідку й передав зібрані дані про противника командуванню. Дії Ковтуна і його групи сприяли успішній переправі частин дивізії на даній ділянці[2]
Указом Президії Верховної Ради СРСР від 15 січня 1944 року за мужність при форсуванні Дніпра і успішної операції в тилу ворога на Правобережній Україні командиру розвідувальної роти 121 гвардійської стрілецької дивізії гвардії капітану Ковтуну Василю Юхимовичу присвоєно звання Героя Радянського Союзу[3].
У 1954 закінчив Військову академію ім. М. В. Фрунзе. Із 1975 гвардіїполковник Ковтун — в запасі. Жив і помер в Кишиневі 30 січня 1996 року.
Герои Советского Союза: Краткий биографический словарь / Пред. ред. коллегии И. Н. Шкадов. — М. : Воениздат, 1988. — Т. 2. — 863 с. с. — 100 000 прим. — ISBN 5-203-00536-2.
.svg){kind=small}
