Каппа-варіант — це варіантSARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Це одна з трьох підліній лінії Панго B.1.617. Каппа-варіант SARS-CoV-2 також відомий як лінія B.1.617.1 і вперше був виявлений в Індії в грудні 2020 року. До кінця березня 2021 року підваріант каппа становив більше половини захворюваностей, які були зафіксовані з Індії. 1 квітня 2021 року Служба охорони здоров’я Англії назвала його варіантом, що під наглядом (VUI-21APR-01).
Мутації
Амінокислотні мутації варіанту Каппа SARS-CoV-2 нанесені на карту геному SARS-CoV-2 з акцентом на спайку.
Визначення мутацій у варіанті SARS-CoV-2 каппа /br>
L452R. Заміна в положенні 452, заміна лейцину на аргінін. Цей обмін забезпечує більш високу спорідненість білка-шипа до рецептора ACE2 разом із зниженням здатності імунної системи розпізнавати.[6][7]
E484Q. Заміна в позиції 484, заміна глутамінової кислоти на глутамін. Ця зміна надає варіанту сильніший потенціал зв’язування з ангіотензин-перетворювальним ферментом 2, а також кращу здатність уникати імунної системи хазяїна.[8][9]
P681R. Заміна в положенні 681, заміна проліну на аргінін.[10][8]
Європейський центр з профілактики та контролю захворювань (ECDC) також перераховує четверту мутацію, що цікавить:[11]
D614G. Це заміна в позиції 614, заміна аспарагінової кислоти на гліцин.[12] Інші варіанти, які мають мутацію D614G, включають варіанти бета і дельта, і мутація пов’язана з підвищеною інфекційністю.[13][14]
Дві інші мутації, які можна знайти ближче до обох кінців області спайка, - це T95I і Q1071H.[4]
Історія
Міжнародне виявлення
Варіант Каппа вперше був ідентифікований в Індії в грудні 2020 року.[15]
Станом на 11 травня 2021 року щотижневі епідеміологічні оновлення ВООЗ повідомляли про 34 країни з виявленням субваріанта[16], однак до 25 травня 2021 року кількість країн зросла до 41.[17][18] Станом на 19 2021 Велика Британія виявила загалом 418 підтверджених випадків захворювання SARS-CoV-2 Каппа. 6 червня 2021 року група з 60 випадків, виявлених в австралійському місті Мельбурн, була пов’язана з варіантом Каппа.[19] За даними GISAID у липні 2021 року, Індія надала більше генетичних зразків варіанту Каппа, ніж будь-яка інша країна.[20]
Передача спільноти
У технічному брифінгу з охорони здоров’я Англії від 22 квітня 2021 року повідомлялося, що в Англії було виявлено 119 випадків цього підваріанта з концентрацією випадків в районі Лондона та регіонах Північного Заходу та Сходу Англії. Із 119 випадків 94 мали встановлений зв’язок із подорожами, 22 випадки все ще перебувають у розслідуванні, але решта 3 випадків не мають жодного відомого зв’язку з подорожами.
2 червня The Guardian повідомила, що принаймні 1 з 10 випадків спалаху в австралійському штаті Вікторія були викликані контактом з незнайомими людьми, і що передача через громаду була пов’язана з кластерами варіанту Каппа. Проте експерт з інфекційних захворювань, професор Грег Дор, сказав, що варіант Каппа поводиться «так само, як ми бачили раніше» по відношенню до інших варіантів в Австралії.[21]
Ефективність вакцини
Вакцини ефективні проти варіанту Каппа, хоча і в меншій мірі, ніж проти вихідного штаму.
Дослідження, проведене Оксфордським університетом у червні 2021 року, показало, що вакцина Oxford-AstraZeneca та вакцинаPfizer-BioNTech були ефективними проти варіантів Kappa та Delta, що свідчить про те, що поточні вакцини забезпечують захист від цих варіантів, хоча й з незначним зниженням нейтралізації.[22]
Коваксин також був визнаний ефективним проти варіанту Каппа (B.1.617.1), як і для інших варіантів.[23]
Вакцина Moderna від COVID-19 також виявилася ефективною проти варіанту Каппа, хоча й із зменшенням нейтралізації в 3,3-3,4 рази.[24]
Статистика
Cases by country (Updated as of 13 September 2021) GISAID[25]
↑Harvey, WT; Carabelli, AM; Jackson, B; Gupta, RK; Thomson, EC; Harrison, EM та ін. (2021). SARS-CoV-2 variants, spike mutations and immune escape. Nat Rev Microbiol. 19 (7): 409—424. doi:10.1038/s41579-021-00573-0. PMC8167834. PMID34075212. For example, recently detected viruses of lineage B.1.617.1 were anticipated to show altered antigenicity due to the presence of the substitutions L452R and E484Q, which have been described as affecting antibody recognition.
↑SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. cdc.gov. 4 червня 2021. Архів оригіналу за 24 червня 2021. Процитовано 8 червня 2021. These variants share one specific mutation called D614G... ...There is evidence that variants with this mutation spread more quickly than viruses without this mutation.
