Вихованець молодіжної академії «Гуарані». Дорослу футбольну кар'єру розпочав 1994 року в «Сан-Каетано», а наступного року повернувся до «Гуарані». У 1996 році підписав контракт із мексиканським клубом «Селая». У Прімера Дивізіоні дебютував 18 січня в нічийному (1:1) матчі проти «Веракруса», а 1 лютого відзначився дебютним голом за нову команду у переможному (3:0) матчі проти «Атласу».
У 1998 році побував в оренді в іспанському«Логроньєсі». Протягом півроку перебування у вище вказаному клубі залишався гравцем основи, а його команда займала місце трохи вище зони вильоту в турнірній таблиці Сегунда Дивізіону.
Взимку 1999 року перейшов до «Крус Асуля», з яким уклав повноцінний договір. Грав за «Сементерос» протягом 4 років, у складі мексиканців став учасником фіналу Кубку Лібертадорес 2001, проти «Бока Хуніорс». У команді був одним з провідних футболістів. Зіграв у 154 матчах за «Крус Асуль», в яких відзначився 29-ма голами. У першому сезоні (зима 1999) він посів друге місце в чемпіонаті Мексиці.
Влітку 2003 року Пінейро, який більше не виходив у стартовому складі «Крус Асуля», перейшов в іспанський клуб «Осасуни», який очолював мексиканець Хав'єр Агірре. Дебютував у Прімера Дивізіоні 14 вересня в переможному (1:0) матчі проти «Атлетіко» (Мадрид) й отримав другу жовту і, як наслідок, червону картку на 89-й хвилині матчу. У клубі з Памплони провів півроку, зіграв у 6-ти матчах чемпіонату, але у 5-ти з них вийшов на заміну.
У 2004 році «Атлас» повернув його до Мексики. Однак у 2005 році Жуліо повернувся на батьківщину, щоб грати за «Понте Прету» з міста Кампінас, принципового суперника його колишнього клубу «Гуарані». Того ж року повернувся до Мексики, але цього разу грав за «Монтеррей». Провів у команді шість місяців і, де залишався основним гравцем, посів друге місце в національному чемпіонаті в Апертурі 2005.
Наприкінці кар'єри нетривалий період часу виступав за «УНАМ Пумас», але в команді основним гравцем не став і виходив на поле, здебільшого, з лави запасних. Влітку 2008 року працевлаштувався в японському клубі «Кіото Санґа». Однак незабаром через травму вибув на тривалий проміжок часу, а його команда понизилася в класі. Залишив команду після закінчення сезону. Завершив кар’єру у 31-річному віці в клубі «Сертаожиньйо», який виступав у Лізі Пауліста.
