В 1463 році боснійський король Стефан Томашевич припинив сплачувати данину туркам, османський султан Мехмед II особисто повів військо на Боснію. Боснійське військо було розбите, а король Стефан був узятий в полон у Ключі, привезений до Яйця і там страчений у місці. На землях королівства було створено Боснійський санджак, а Іса-бей Ісакович стає першим санджак-беєм.
У період між 1463 і 1580 роками Боснійський санджак був частиною еялету Румелія. Після створення вілаєту Боснія в 1580 році, боснійський санджак став його центральною провінцією.
У період між 1864 роком та австро-угорською окупацією Боснії в 1878 році, територія санджаку була частиною вілаєту Боснія, який став наступником еялету Боснія після адміністративних реформ у 1864 році, відомих як "Закон Вілаєту". Хоча вілаєт Боснія офіційно все ще була частиною Османської імперії до 1908 року, боснійський санджак припинив своє існування в 1878 році.
Баня-Лука стала центром санджака за деякий час до 1554 року, до 1580 року, коли було створено Боснійський еялет. Боснійські бейлербеї знаходилися в Баня-Луці до 1639 року.
Населення
Апостольський відвідувач Петро Масаречі стверджував у своєму звіті за 1624 рік, що населення Боснії складало 450 000 мусульман, 150 000 католиків і 75 000 православних.