Ампліфікація ДНК-повторів

Ампліфіка́ція ДНК-повто́рів — це геномний фінгерпринтинг на основі ПЛР.

Суть методу

Прокаріотичний геном містить багато коротких послідовностей, що повторюються. Хоча функції їх повністю ще не відомі, вони використовуються як мішень для ідентифікації мікроорганізмів в навколишньому середовищі. Важливим підкласом цих елементів є міжгенні паліндромні повтори (REP) — висококонсервативні інвертовані повтори, що мають загальний вигляд:

5'-GCCG/TGAT GGCGG/ACGG/ACGC/T G/ACGC/TCTTATCC/AGGCCTAC- 3'

REP-повтори локалізовані в міжгенних ділянках хромосоми, які не транслюються, в кількості від 500 до 11000 копій. Досить поширеними є і ентеробактеріальні ендогенні консенсусні повтори (ERIC), які також являють собою інвертовані повтори, та BOX-елементи. Висока консервативність цих повторів дозволила створити комплементарні їм праймери для ампліфікації з допомогою ПЛР локусів бактеріального геному, локалізованих між REP чи двома ERIC-елементами. Результатом цієї реакції є утворення набору фрагментів ДНК від 200 п. о. до більш ніж 6 т. п. о., розділених в агарозному гелі, котрі відображають організацію геному даного мікроорганізму.

Значення і використання

REP-ПЛР широко використовується для ідентифікації патогенів, диференціації штамів, оцінки генетичного поліморфізму популяцій мікроорганізмів. Цей метод застосовують для досліджень в галузях медичної мікробіології, мікробної екології та генетики бактерій. Праймери, специфічні до REP-, ERIC- і BOX-елементів, можна використати для створення фінгерпринтів різних бактерій, в тому числі грам-негативних і грам-позитивних фітобактерій, а також мікроорганізмів, що мають клінічне значення.

Література

  1. Lupski J. K., Wientsock G. M. Short interspersed repetitive DNA sequences in prokaryotic genomes // J.Bacteriol. — 1992. — 174. — № 14. — p. 4525—4529.
  2. Versalovic J., Koeuth T., Lupski J. R. Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes // Nucl. Acids Res. — 1991. — 19. — p. 6823 — 6831.


Сахарин Це незавершена стаття з молекулярної біології.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Read other articles:

Daftar Duta Besar Indonesia untuk Kanada

Duta Besar Indonesia untuk KanadaMerangkap ICAOLambang Kementerian Luar Negeri Republik IndonesiaPetahanaDaniel Tumpal Sumurung Simanjuntaksejak 17 November 2021KantorOttawa, KanadaDitunjuk olehPresiden IndonesiaPejabat perdanaAli SastroamidjojoDibentuk1953Situs webkemlu.go.id/ottawa Berikut adalah daftar diplomat Indonesia yang pernah menjabat Duta Besar Republik Indonesia untuk Kanada: No. Foto Nama Mulai menjabat Selesai menjabat Merangkap Diangkat oleh Ref. 1 Ali Sastroamidjojo 1953 ...

 

 

Chemistry (TV series)

2011 American erotic thriller drama television series This article is about the 2011 American television series. For the 2010 Pakistani television drama serial, see Chemistry (serial). ChemistryGenre Erotica Thriller Comedy drama Created by Richard Christian Matheson Norman Steinberg Written by Richard Christian Matheson Norman Steinberg Directed by Mark Haber Brian Trenchard-Smith Michael Robison Starring Ana Alexander Jonathan Chase Ragan Brooks Jeremy Kent Jackson Sally Kellerman Chad Ever...

 

 

JKT48V

Untuk grup idola nyata yang membentuk sub-unit virtual ini, lihat JKT48. JKT48VAnggota JKT48V dari sebelah kiri(Kanaia, Pia, Tana)Informasi latar belakangAsalIndonesiaGenreRockJ-popTahun aktif2023 – sekarang (0 tahun)LabelIndonesia Musik Nusantara (musik)AKA Virtual (virtual)Artis terkaitJKT48Situs webwww.jkt48.com/jkt48vAnggotaPia MeraleoTana NonaKanaia Asa JKT48V adalah sebuah full virtual sub-unit dari grup idola terkenal JKT48, yang berbasis di Indonesia. Sub-unit ini diumumkan pada har...

Ikatan rangkap tiga

Suatu ikatan rangkap tiga dalam kimia adalah ikatan kimia antara dua atom yang melibatkan enam elektron ikatan dalam satu ikatan kovalen. Ikatan rangkap tiga yang paling umum adalah antara dua atom karbon, dan dapat ditemui pada alkuna. Gugus fungsional lain yang mengandung ikatan rangkap tiga adalah sianida dan isosianida. Beberapa molekul diatomik seperti dinitrogen dan karbon monoksida juga berikatan rangkap tiga. Dalam struktur rangka, ikatan rangkap tiga digambarkan sebagai garis tiga pa...

 

 

Ithaca (island)

Greek island For the mythical island, see Homer's Ithaca. Regional unit in Ionian Islands, GreeceIthaca Περιφερειακή ενότητα / ΔήμοςΙθάκηςRegional unitView of VathyIthaca within the Ionian IslandsCoordinates: 38°22′N 20°43′E / 38.367°N 20.717°E / 38.367; 20.717CountryGreeceRegionIonian IslandsCapitalVathyGovernment • MayorDionisios StanitsasArea • Total117.8 km2 (45.5 sq mi)Population (20...

 

 

Russula vesca

Basidiomycete mushroom of the genus Russula Russula vesca Conservation status Least Concern  (IUCN 3.1)[1] Scientific classification Domain: Eukaryota Kingdom: Fungi Division: Basidiomycota Class: Agaricomycetes Order: Russulales Family: Russulaceae Genus: Russula Species: R. vesca Binomial name Russula vescaFr. (1836) Species of fungus Russula vescaMycological characteristicsGills on hymenium Cap is convex or flatHymenium is freeStipe is bareSpore print is whiteEcology is m...

Andrés Andrade Cedeño

Questa voce sull'argomento Calciatori panamensi è solo un abbozzo. Contribuisci a migliorarla secondo le convenzioni di Wikipedia. Segui i suggerimenti del progetto di riferimento. Andrés Andrade Nazionalità  Panama Altezza 187 cm Peso 78 kg Calcio Ruolo Difensore Squadra  LASK CarrieraSquadre di club1 2016-2017 San Francisco21 (0)2017-2018 Toluca0 (0)2018 Querétaro0 (0)2018-2020 Juniors OÖ34 (4)2018-2021 LASK44 (0)2021-2023 Arminia Bielefeld...

 

 

John Franklin

British naval officer and explorer (1786–1847) For other people with similar names, see John Franklin (disambiguation). Sir John Franklin redirects here. For other uses, see Sir John Franklin (disambiguation). SirJohn FranklinKCH FRS FLS FRGS1828 portrait by Thomas PhillipsLieutenant-Governor of Van Diemen's LandIn office5 January 1837 – 21 August 1843 (1837-01-05 – 1843-08-21)SecretaryJohn MontaguPreceded bySir George ArthurSucceeded bySir...

 

 

Rewari Railway Heritage Museum

Railway museum in Haryana, IndiaRewari Railway Heritage Museumरेवाड़ी रेल संग्रहालयRewari Railway Heritage MuseumLocation in Rewari, IndiaShow map of HaryanaRewari Railway Heritage Museum (India)Show map of IndiaFormer nameRewari Steam Locomotive ShedEstablished2 February 1893 (1893-02-02)LocationNorth end of Rewari railway station, Rewari, Haryana, IndiaCoordinates28°12′31″N 76°36′43″E / 28.2085056°N 76.6120139�...

Ильинцы

У этого термина существуют и другие значения, см. Ильинцы (значения). ГородИльинцыукр. Іллінці Флаг Герб 49°06′ с. ш. 29°12′ в. д.HGЯO Страна  Украина Область Винницкая Район Винницкий Община Ильинецкая городская Городской голова В. Н. Ящук История и география Перв�...

 

 

Grade II* listed buildings in Norfolk

Norfolk shown within England The county of Norfolk is divided into seven districts. The districts of Norfolk are Norwich, South Norfolk, Great Yarmouth, Broadland, North Norfolk, King's Lynn and West Norfolk, and Breckland. As there are 839 Grade II* listed buildings in the county they have been split into separate lists for each district. Grade II* listed buildings in Breckland Grade II* listed buildings in Broadland Grade II* listed buildings in Great Yarmouth Grade II* listed buildings in...

 

 

1. Fußball-Club Nürnberg Verein für Leibesübungen 1990-1991

Voce principale: 1. Fußball-Club Nürnberg Verein für Leibesübungen. 1. Fußball-Club Nürnberg Verein für LeibesübungenStagione 1990-1991Sport calcio Squadra Norimberga Allenatore Arie Haan All. in seconda Willi Entenmann Dieter Lieberwirth Bundesliga15º posto Coppa di GermaniaSecondo turno Maggiori presenzeCampionato: Oechler (32)Totale: Oechler (35) Miglior marcatoreCampionato: Dittwar, Oechler (7)Totale: Dittwar, Oechler (7) StadioStädtisches Stadion Maggior numero di spettat...

Carnegie Prize

International art prize For the Swedish art award, see Carnegie Art Award. Carnegie Gold Medal of Honor (1896) The Carnegie Prize is an international art prize awarded by the Carnegie Museum of Art in Pittsburgh, Pennsylvania. It currently consists of a $10,000 cash prize accompanied by a gold medal. History The Carnegie Prize was established in 1896, to recognize the best painting shown in the first annual exhibition of the Museum of Art, Carnegie Institute. Unlike most American annual exhib...

 

 

Optical time-domain reflectometer

Artikel ini membutuhkan judul dalam bahasa Indonesia yang sepadan dengan judul aslinya. Optical Time-Domain Reflectometer atau biasa disingkat menjadi OTDR, merupakan suatu peralatan optoelektronik yang digunakan untuk mengukur parameter-parameter seperti pelemahan (attenuation), panjang, kehilangan pencerai dan penyambung, dalam sistem telekomunikasi serat optik. OTDR pada dasarnya terdiri dari satu sumber optik dan satu penerima (receiver), modul akuisisi data, CPU, media penyimpanan data, ...

 

 

Paseo Boricua

This article has multiple issues. Please help improve it or discuss these issues on the talk page. (Learn how and when to remove these template messages) This article's tone or style may not reflect the encyclopedic tone used on Wikipedia. See Wikipedia's guide to writing better articles for suggestions. (May 2012) (Learn how and when to remove this message) This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unso...

Belebey (genus)

Extinct genus of reptiles BelebeyTemporal range: Permian, 296–265 Ma PreꞒ Ꞓ O S D C P T J K Pg N Life restoration of Belebey vegrandis Scientific classification Domain: Eukaryota Kingdom: Animalia Phylum: Chordata Class: Reptilia Clade: †Parareptilia Order: †Procolophonomorpha Family: †Bolosauridae Genus: †BelebeyIvakhnenko, 1973 Species †B. vegrandis Ivakhnenko, 1973 (type) †B. maximi Tverdokhlebova, 1987 †B. chengi Müller, Li & Reisz, 2008 †B. augustodunensis...

 

 

Elaeis

Oil palms, genus Oil palm redirects here. For other uses, see List of plants known as oil palm. For the Greek goddess of oil, see Elais. Elaeis African oil palm (Elaeis guineensis) Scientific classification Kingdom: Plantae Clade: Tracheophytes Clade: Angiosperms Clade: Monocots Clade: Commelinids Order: Arecales Family: Arecaceae Subfamily: Arecoideae Tribe: Cocoseae Genus: ElaeisJacq. Species Elaeis guineensis Jacq. Elaeis oleifera (Kunth) Cortés Synonyms[1] Corozo Jacq. ex Giseke ...

 

 

Eleni Angelina Doukaina

Eleni Angelina DoukainaPermaisuri SisiliaKelahiranskt. 1242Kematian1271 – 1242; umur -30–-29 tahunWangsaWangsa Komnenos DoukasAyahMikhael II Komnenos DoukasIbuTheodora PetralifainaPasanganManfredi dari SisiliaAnakBeatrice, Marchioness Saluzzo Fidiricu dari Sisilia Enrico dari Sisilia Enzio dari Sisilia Flordelis dari Sisilia Eleni Angelina Doukaina (skt. 1242 – 1271) merupakan seorang Ratu Sisilia sebagai istri kedua Raja Manfredi. Ratu Eleni adalah putri Mikhael II Komneno...

Pianist

Musician who plays the piano For other uses, see Pianist (disambiguation). This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: Pianist – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (November 2021) (Learn how and when to remove this message)Sergei Rachmaninoff at the piano Motion capture of two pianists' fingers ...

 

 

Quo elongati

Questa voce o sezione sull'argomento documenti della Chiesa cattolica non cita le fonti necessarie o quelle presenti sono insufficienti. Puoi migliorare questa voce aggiungendo citazioni da fonti attendibili secondo le linee guida sull'uso delle fonti. Segui i suggerimenti del progetto di riferimento. Quo elongatiBolla pontificiaStemma di Papa Gregorio IXPonteficePapa Gregorio IX Data1230 Traduzione del titoloFino a che punto Argomenti trattatiNegazione del valore giuridico del Testamen...