Основний парк авіакомпанії складають гідролітаки de Havilland Canada. Спільно з регіональним авіаперевізником Air West Coast компанія експлуатує два гидроаэропорта: Міжнародний аеродром Ванкувер-Харбор і Аеродром Вікторія-Іннер-Харбор.
Авіакомпанія Windoak Air Service була заснована в 1982 році для виконання чартерних рейсів на гідролітаках і забезпечення потреб підприємств лісової промисловості в провінції Британська Колумбія. У 1993 році Harbour Air придбала невеликого перевізника місцевого значення Trans-Provincial Airlines, розширивши тим самим географію польотів за рахунок збільшення чартерних та запровадження кількох регулярних рейсів придбаної авіакомпанії.
Тепер Harbour Air позиціонує себе як найбільша у світі комерційна авіакомпанія, що використовує парк гідролітаків. У червні 2007 року компанія сформувала невелике дочірнє підрозділ Harbour Air Malta, яка має власний гідролітак DHC-3 Turbo Otter, базується в аеропорту Валетта-Харбор і здійснює регулярні рейси на острів Гозо, а також проводить повітряні екскурсії навколо сусідніх острівців.
Harbour Air випускає власний польотний журнал для пасажирів «Coastlines Magazine».
Маршрутна мережа авіакомпанії
Станом на жовтень 2007 року авіакомпанія Harbour Air виконувала рейси по наступним пунктам[2]:
Аеродром Ванкувер-Харбор (Ванкувер)
Вікторія
Нанаймо
Галф-Айлендс (Гангіс, Мэпл-Бей, Бедуелл-Харбор)
Міжнародний аеродром Ванкувер-Харбор (Річмонд)
Вікторія
Нанаймо
Аеродром Вікторія-Іннер-Харбор (Вікторія)
Ванкувер
Річмонд (Міжнародний аеропорт Річмонд)
Ленглі
Аеропорт Нанаймо-Харбор (Нанаймо)
Ванкувер
Річмонд
Регіональний аеропорт Ленглі (Ленглі)
Вікторія
Флот
Станом на березень 2009 року повітряний флот авіакомпанії Harbour Air складався з 33 літаків: