До січня 1941 року на судні проведені роботи щодо модернізації та озброєння. Спочатку діяло в домашніх водах, у серпні 1941 року судно залучалося до перекидання військ з Клайда для операції «Грей», запланованої окупації Азорських островів. Втім, операцію було скасовано, і «Роял Скотсмен» повернувся до Клайда. 17 вересня 1941 року воно приєдналося до військового конвою WS 11X у Клайді для перевезення військового персоналу до Гібралтару як підкріплення для Мальти за планом операції «Гальбед». У жовтні повернулося до Великої Британії для навчання з персоналом штабом Об'єднаних операцій.
З січня 1942 року «Роял Скотсмен» брало участь у масштабних навчаннях, що проводилися з метою підготовки до великих десантних операцій. 26 жовтня судно відпливло до Гібралтару у складі військового конвою KMF 1 для вторгнення в Північну Африку в рамках операції «Смолоскип». У перші години 8 листопада судно висадило особовий склад 1-го американського батальйону рейнджерів, щоб захопити порт Арзев, а потім було залучено до транспортування військ та техніки в західному Середземномор'ї, діючи разом з суднами «Роял Ольстермен», «Принцес Беатрікс» та «Квін Емма».
.svg){kind=small}
