Тече вздовж Юдомського хребта та Юдомо-Майського нагір'я, у верхів'ї — головним чином на південь, розбивається на безліч рукавів, в районі гори Юдома (951 м) плавно повертає на південний захід, русло стає звивистим. Після впадіння річки Акачан повертає на захід, при чому знову розбивається на рукави. Після впадіння Безимянки — повертає на північний захід, а після гирла Кютеп — знову повертає на південний захід, а далі на південь. Після гирла Качи — повертає на південний захід і поперемінно повертаючи на захід і південний захід впадає у річку Майю з правого берега за 5 км вище від села Усть-Юдома, за 179 км від її гирла (впадіння у річку Алдан). На значному протязі (від місця приблизно за 25 км вище Югоронка до гирла) служить кордоном між Республікою Саха Якутія та Хабаровським краєм.
Течія швидка у звивистому руслі із крутими берегами, великою кількістю підводних каменів, порогів та мілин. Навесні сильно розливається, затоплюючи долину у гирлі.
Довжина річки — 765 км (від витоку річки Ніткан — 820 км), площа басейну — 43 700км². Судноплавна від гирла на 217 км.
Гідрологія
Живлення річки дощове та снігове (з переважанням снігового), у верхів'ях і льодовикове. Повінь з травня по вересень (максимум в червні), з грудня по квітень межень. Замерзає в жовтні, розкривається в травні.
За період спостереження протягом 55 років (1944–1998) на станції у гирлі річки Курунґ-Тирґиях (195 м над р. м.) за 12 км від гирла, впадіння її у річку Майю[6]. Середньорічна витрата води яка спостерігалася тут за цей період становила 342 м³/с для водного басейну 43 600 км², що становить близько 99,8% від загальної площі басейну річки. Величина прямого стоку в цілому по цій частині басейну становить — 248 міліметра на рік, що є досить високим для басейну річки Лени.
За період спостереження встановлено, мінімальний середньомісячний стік становив 3,71 м³/с (у березні), що становить 0,34% від максимального середньомісячного стоку, який відбувається у липні місяці та становить — 1 081 м³/с і вказує на дуже велику амплітуду сезонних коливань.
За період спостереження, абсолютний мінімальний місячний стік (абсолютний мінімум) становив 1,1 м³/с (у березні 1953 року), абсолютний максимальний місячний стік (абсолютний максимум) становив 3 100 м³/с (у червні 1970 року).
Що стосується літнього періоду (з червня по вересень), мінімальний місячний потік спостерігався у вересні 1955 року і становив 164 м³/с.
Показники середньомісячної витрати води річки: Юдоми за 55 років спостереження 1944-1998 на станції: гирло Курунґ-Тирґиях (за 12 км від гирла Юдоми), м³/с:
Басейн, в тому числі і береги річки малозаселені. На ній розташовано кілька невеликих населених пунктів, в основному поселень старателів та мисливців і в більшості нежилих (від витоку до гирла): Нижня База радіорелейної станції 3/104А «Мілан»; селища: Огоньок (неж.), Вольний (Ключ-Шлі, неж.), Югоронок, Итига (неж.), Усть-Юдома (за 5 км від гирла).