Народився 15 березня 1979 року. Батько — науковець-анатом, доктор медичних наук Віктор Черкасов (1953—2020).
В 2002 році закінчив лікувальний факультет № 1 Національного медичного університету імені О. О. Богомольця з відзнакою.
2002—2004 — старший лаборант кафедри патологічної анатомії.
2004—2013 — асистент кафедри патологічної анатомії.
2013—2018 — доцент кафедри патологічної анатомії № 1.
З 2018 року працював професором кафедри патологічної анатомії № 1.
У 2005 році захистив кандидатську дисертацію на тему «Морфофункціональна характеристика слизової оболонки цибулини дванадцятипалої кишки при дуоденіті та виразковій хворобі дванадцятипалої кишки, асоційованих з Helicobacter pylori».
У 2016 році захистив дисертацію на здобуття наукового ступеню доктора медичних наук на тему «Структурні зміни в тимусі за умов експериментальної опікової хвороби».
Ельдар Вікторович Черкасов мав близько 80 друкованих робіт, в тому числі в журналах, які входять до Scopus.