У дорослому футболі дебютував 1991 року виступами за команду «Замалек», в якій провів десять сезонів. Разом із «Замалеком» він виграв три чемпіонати Єгипту в сезонах 1991/92, 1992/93 та 2000/01 та Кубок Єгипту 1998/99. Втім найбільших успіхів здобув на міжнародній арені, вигравши африканську Лігу чемпіонів (1993, 1996), Кубок володарів кубків КАФ (2000), Суперкубок Африки (1994, 1997) та Афро-азійський клубний чемпіонат (1997).
Завершив ігрову кар'єру у кувейтській команді «Аль-Кувейт», за яку виступав протягом 2001—2002 років.
1992 року дебютував в офіційних матчах у складі національної збірної Єгипту. У складі збірної був учасником Кубка африканських націй 1998 року у Буркіна Фасо, здобувши того року титул континентального чемпіона. Ель-Шешині зіграв на ньому у трьох матчах: проти Замбії (4:0) та Марокко (0:1) на груповому етапі та чвертьфінал з Кот-д'Івуаром (0:0, пен. 5: 4). Всього протягом кар'єри у національній команді, яка тривала 8 років, провів у її формі 15 матчів.
