У 1990-х роках займався педагогічною діяльністю та музичним виконавством.
Починаючи від 2000-х С. С. Недериця розпочав активну музикотерапевтичну діяльність, офіційно отримавши відповідну ліцензію.
Всередині 2000-х Степан Недериця започаткував видавничу справу, і на теперішній час (весна 2017 року) є директором видавництва «Classica», яке випускає музикотерапевтичну продукцію, зокрема дитячі книги з музичним супроводом для всебічного естетичного розвитку.
Степан Недериця є творцем і популяризатором декількох методик музикотерапії, зокрема «ефект Моцарта для новонароджених», а також оригінальної теорії споживання води (структурування води в домашніх умовах). Ноу-хау Стефана Недериці полягає в тому, що він першим винайшов і втілив ідею поєднання класичної музики і звуків природи (спів пташок, дельфінотерапія).