Міністерство Македонії і Фракії — міністерство Греції, що опікується справами грецьких регіонів Македонія та Фракія. До 1988 року воно носило назву Міністерство Північної Греції. 2009 року тодішній прем'єр-міністр Йоргос Папандреу фактично скасував міністерство, оскільки на посаду міністра не було нікого призначено. Натомість почав функціонувати Генеральний секретаріат у справах Македонії і Фракії. Після приходу до влади Нової Демократії на чолі із Антонісом Самарасом 21 червня 2012 року міністерство відновлено[1].
Міністерство Македонії і Фракії єдине міністерство у системі виконавчої влади Греції, що базується не в столиці Афінах, а в місті Салоніки.