Автор 316 наукових робіт. Отримав 33 патенти СРСР і України. Створив наукову і кадрову школу в галузі терапевтичної стоматології. Під його керівництвом і консультаціями виконано й захищено 13 докторських і 52 кандидатські дисертації.
Вперше у світі створив експериментальні моделі пародонтозу та генералізованого пародонтиту. Запропонував оригінальні класифікації захворювань пародонту та слизистої оболонки порожнини рота. Науково обґрунтував і впровадив у практику ферментні препарати. Розробив методи лікування пародонту за допомогою кріохірургії, вітамінних та антибактеріальних препаратів.
Громадська діяльність
З 1975 року Микола Данилевський голова Республіканського наукового стоматологічного товариства України; головний редактор та член редакційної колегії п'яти наукових стоматологічних журналів.