Гюнтер Бенке починав свою спортивну кар'єру як гравець, однак у віці 25 років після травми коліна її довелося завершити, і в 1980 році він вирішив присвятити себе суддівству[2].
З 1991 року Бенке став обслуговувати матчі австрійської Бундесліги. У 1993 році він отримав категорію ФІФА і відсудив гру молодіжних команд Албанії і Данії — перший у своїй міжнародній кар'єрі. У 1995 році Бенке вперше був призначений на матч Ліги чемпіонів, в якому зійшлися «Русенборг» і «Блекберн Роверс».