Помер 10 червня1923 року в місті Стокгольмі, не залишивши після себе спадкоємців (вчений ніколи не був одруженим).
У рік смерті Енестрома американський історик науки бельгійського походження Джордж Сартон написав про вченого такі слова: «Ніхто не зробив більшого для здорового розвитку наших досліджень» і додав: «Сама присутність Енестрома змушувала кожного вченого, який присвятив себе історії математики, підвищувати свою уважність і покращувати свою роботу»[16].
Бібліографія
Striden om det isoperimetriska problemet (Uppsala universitets «Årsskrift», 1876)
Differenskalkylens historia (те саме видання, 1879).
Om matematikens historia såsom studieämne vid Nordens högskolor («Tidsskr. for mathematik», 1880).
Anteckningar om matematikern Petrus de Dacia och hans skrifter (1885-86).
Statiska undersökningar rörande studie- och examensförhållanden vid svenska universitet (1888)
Emanuel Svedenborg såsom matematiker («Bihang till Vet. akad:s handl.», 15, 1890).
Programme d’un cours universitaire d’histoire des mathématiques («Bibliotheca mathematica», 1890).
Om uppkomsten af tecknen + och - samt de matematiska termerna «plus» och «minus» (1894).
Verzeichnis der Schriften Leonhard Eulers («Jahresbericht der Deutschen Mathematiker-Vereinigung», 1910).
Om sättet att på matematiskt-statistisk väg bestämma åldersfördelningen för en grupp gifta kvinnor, då man känner åldersfördelningen för deras män (1893).
Befolkningsstatistiska formler för dödligheten, då hänsyn tages till emigration och immigration (1896).
Om aritmetiska och statistiska metoder för proportionella val (того ж року).
Av icke matematiskt innehåll är bland annat: Statistiska undersökningar rörande studie- och examensförhållanden vid de svenska universiteten (1888)[9].