Заснований 1940 року. Виступає у найвищому дивізіоні Швеції. Клуб було створено підлітками 14 - 15 років, які хотіли не просто грати у футбол, а грати на найвищому рівні.
Перші роки
Тривалий час «Геккен» грав на юнацькому та молодіжному рівнях. Але згодом клуб приєднався до участі у турнірах дорослих команд. І довго команда не могла піднятися з найнижчих дивізіонів.
60-ті роки знаменувалися в історії клуба відкриттям нового стадіону, відомого як «Геккенсборг». У 1978 році створюється жіноча команда «Геккена». А у 1982 році «Геккен» вперше піднімається до Аллсвенскан.
Нове тисячоліття
У ХХІ столітті «Геккен» ще раз повернувся до Супереттан. Вже в 2007 році команда дебютує на євроарені, пройшовши два етапи Ліги Європи. У 2012 році «Геккен» фінішує другим у чемпіонаті Швеції, поступившись лише двома балами чемпіону «Ельфсборгу». Ще двічі команда тріуфувала у розіграші кубка Швеції.
Принципові суперники
Важливі і принципові матчі «Геккен» проводить з іншими командами з міста Гетеборг — ІФК «Гетеборг», ГАІС та «Ергрюте».