Клуб був створений в 1988 році під назвою «Бангкокський університет» як команда для студентів в університету. Клуб пройшов шлях від провінційного футболу до тайської Прем'єр-Ліги, куди вперше вийшов у 2003 році.
2006 року команда вперше в історії стала чемпіоном Таїланду, що також дозволило команді дебютувати у Лізі чемпіонів АФК. Там у турнірі 2007 року команда не здобула жодної перемоги у груповому етапі (3 нічиї і 3 поразки) і зайняла останнє місце у групі.
2009 – початок нової ери
На початку сезону 2009 року, клуб змінив свою назву на «Бангкок Юнайтед», підписавши партнерську угоду з адміністрацією Бангкока відповідно до нових правил Футбольної асоціації Таїланду, за якими всі команди у вищому дивізіоні повинні бути зареєстровані у формі товариства з обмеженою відповідальністю.
Після зміни назви клуб переїхав на нову арену — Тайсько-японський стадіон, що вміщував 10,320 глядачів. Втім у тому ж сезоні «Бангкок Юнайтед» дивом уникнув вильоту з тайські Прем'єр-ліги, але вже наступного року зайняв передостаннє 15-те місце і таки вилетів з еліти.
Провівши два сезони у другому дивізіоні, з 2013 року «Бангкок Юнайтед» знову став виступати у вищому дивізіоні, поступово покращуючи свої позиції і у 2016 та 2018 роках став віце-чемпіоном Таїланду, а 2017 року став бронзовим призером.
↑King, Ian; Schöggl, Hans; Stokkermans, Karel (20 березня 2014). Thailand – List of Champions. RSSSF. Архів оригіналу за 16 July 2014. Процитовано 29 жовтня 2014.