İsaakios Komnenos ya da Comnenus (Yunanca: Ἰσαάκιος Κομνηνός, Isaakios Komnēnos; yaklaşık 1113 - 1154'ten sonra), Bizans İmparatoru II. İoannis ile Macaristanlı İrini'nin üçüncü oğludur.

1143 yılında, ölümünden hemen önce, II. İoannis veliahtı olarak üçüncü oğlu İsaakios hala hayatta olmasına rağmen dördüncü oğlu Manuil'i seçti. İsaakios, babasının ölümünü öğrenmeden önce, Manuil, Megas Domestikos ("Bizans ordusu komutanı") İoannis Aksuh ile güçlü bir şekilde dönüp, başkenti kontrol altına almıştı. Aksuh, II. İoannis'in arzularına saygılı olmasına rağmen, ölmek üzere olan imparatoru İsaakios'un daha bir aday olduğu konusunda ikna etmek için uğraştığı kaydedilmiştir. Bazı din adamları, askerler ve saray çevresi, İsaakios'un hükümdarlığa daha iyi uyduğunu düşünseler de, İsaakios kardeşine karşı taht yarışından çekildi.^[1]

1145-1146 yıllarında, Manuil, İsaakios ile beraber Selçuklu Hanedanına karşı sefer düzenlemişlerdir. Kardeşler arası ilişki kolay olmasa da, aralarında açık bir ihtilaf yoktu. İsaakios, saray unvanı "sebastokratōr" olmaktan memnundu. İsaakios'un evliliklerinden doğan kızları, Manuil için dış politika için yararlı araçlar olmuştur.

İlk karısı, Theodora'dan beş çocuğu vardı:

• Aleksios Komnenos.
• İrini Komnini, İsimsiz Doukas Kamateros ile evlenerek, Kıbrıslı İsaakios Komnenos annesi olmuştur.
• İoannis Komnenos.
• Anna Komnini, Konstantin Makrodoukas ile evlendi.
• Maria Komnini, Macaristan Kralı IV. Stephen ile evlendi.

İkinci karısı, İrini Synadene'dan iki kızı vardı:

• Theodora Komnini, Kudüs Kralı III. Baudouin ile evlendi. Daha sonra I. Andronikos'un metresi.
• Eudokia Komnini, Montpellierli VIII. William ile evlendi.

Özel

Genel

• Varzos, Konstantinos (1984). Η Γενεαλογία των Κομνηνών [Komninosların Soyağacı] (PDF) (Yunanca). A. Selanik: Bizans Araştırmaları Merkezi. OCLC 834784634. 
• Magdalino, Paul (1993). The Empire of Manuel I Komnenos, 1143-1180. Cambridge University Press.