Müze 1941 yılında Başkurdistan Hükümeti tarafından kurulmuştur.[1] Lenin 1900 yılının Şubat ve Haziran ayında olmaz üzere Ufa'yı iki kez ziyaret etti. İkinci ziyaret sırasında eşi tarafından Ufa'daki Zhandarmskaya (Günümüzde Krupskaya) ve Hapishane (Günümüzde Dostoyevski) sokaklarının köşesinde yer alan asma katlı bir ev kiralandı.Lenin kiralanan bu evde yaklaşık üç hafta yaşamıştır. Lenin'in Ufa'daki bu kalışının anısına bir müze düzenlenmesine karar verildi.
Müzenin Ufa Şehir İdaresi Müzesi'ne aktarılmasından bu yana 2015 yılında kapanma tehdidi altında olduğu bildirilmiştir.[2][3][4]