Manuel Lobo Antunes (d. 27 Haziran 1958, Lizbon) Portekizli büyükelçi.
Hukuk alanında lisans yapmış ve Portekiz Katolik Üniversitesi'nde Avrupa Çalışmaları alanında lisans üstü eğitim görmüştür. 1984 yılında diplomatik kariyerine başlamış, 2001-2002 yıllarında Başbakan António Guterres'in diplomatik danışmanı, 2004-2005 yıllarında Dışişleri Bakanlığı Avrupa İşleri Genel Müdürü olmuştur. José Sócrates Hükûmeti döneminde 2005-2006 yıllarında Milli Savunma Devlet Sekreteri ardından 2008 yılına dek Dışişleri Devlet Sekreteri olmuştur. 2008-2012 yıllarında Avrupa Birliği Daimi Temsilcisi, 2012-2016 yılları arasında ise İtalya Büyükelçisi olarak görev üstlenmiştir. 2016 yılı itibarıyla Birleşik Krallık Büyükelçisidir.