Epitoplar iki gruba ayrılır. Lineer epitoplar, antikorların molekülde bağlanabildiği, molekülün lineer yapısında (proteindeamino asitlerin birbirlerine bağlanma sırası, polisakkarittemonosakkaritlerin birbirlerine bağlanma sırası) birbirlerine komşu olan yapı taşlarından oluşan epitoplardır. Konformasyonel epitoplar ise molekülün lineer yapısında komşuluğu bulunmayıp, üç boyutlu, katlanmış yapısında antikora beraberce bağlanan yapı taşlarından oluşan epitoplardır.[2]