Ayhan Alkış (d. 28 Ocak 1946, Bor, Niğde), Türk harita mühendisi, akademisyen. Eski Yıldız Teknik Üniversitesi rektördür.

1969 yılında İstanbul Yüksek Teknik Okulu harita ve kadastro mühendisliği bölümünden mezun olmuş ve aynı kurumda bir yıl sonra asistan olarak görev almıştır. 1974–1981 yıllarında Braunschweig Teknik Üniversitesinde doktorasını tamamlayıp araştırmacı olarak çalışmıştır.

İstanbul Devlet Mühendislik ve Mimarlık Akademisinde (daha sonra akademi Yıldız Teknik Üniversitesi adını almıştır.) 1978'de doçent olmuştur, 1989 senesinde profesör olmuştur. Ayrıca Işık Üniversitesinde de ders vermiştir.^[1] Yerel yönetimlerle yapılan çeşitli projelerde yürütücülük, danışmanlık ve koordinatörlük yapmıştır.

1996-2004 yıllarında iki dönem Yıldız Teknik Üniversitesi rektörü olmuş ve 2003–2004 yılında Üniversitelerarası Kurul başkanlığı görevini üstenmiştir.^[2][3]

Merhum Prof. Dr. Zübeyde Alkış ile evli olup iki çocuk babasıdır. İngilizce ve Almanca bilmektedir.