Kotschy var 1836–38 deltagare i Joseph Russeggers vetenskapliga expedition till Orienten och länderna vid Nilen samt fortsatte därefter på egen hand under ytterligare några år sin forskning i olika delar av österlandet. Detta besökte han därefter flera gånger, även sedan han 1852 blivit biträdande kustos vid botaniska hovkabinettet i Wien. Han hemförde till Europa pressade växter i hundratusental och berikade därigenom vetenskapen med en mängd nya arter.
