Juynboll blev 1831 professor i orientaliska språk vid Ateneum i Franeker, 1841 vid universitetet i Groningen och 1845 i Leiden. Han inlade stora förtjänster om den arabiskahistorieforskningen och geografin liksom om bekantgörandet av den samaritanska historien och litteraturen. Bland hans skrifter märks Commentarii in historiam gentis samaritanae (1846), Liber Josuae, chronicon samaritanum, arabice conscriptum (jämte latinsköversättning, 1848) och Lexicon geographicum, cui titulis est, Marâsid al ittilâ’ ‘ala asmâ’ al-amkina wa-l-biqâ (3 band arabisk text, 1852–1854, och 3 band innehållande inledning och kommentar, 1859–1864).