Säsongen 1997 fick han till slut debutera i formel 1 för Sauber. Några poäng tog han dock inte, utan blev mest berömd för att kontroversiellt ha hindrat Michael Schumachers rival Jacques Villeneuve i finalen i Europas Grand Prix. Fontana fick därefter inget nytt kontrakt med Sauber, utan körde senare i det argentinska standardvagnsmästerskapet.