Munderkingen är en stad i Alb-Donau-Kreis i förbundslandet Baden-Württemberg i Tyskland. Folkmängden uppgår till cirka 5 400 invånare, på en yta av 13,07 kvadratkilometer.
Staden ingår i kommunalförbundet Munderkingen tillsammans med kommunerna Emeringen, Emerkingen, Grundsheim, Hausen am Bussen, Lauterach, Obermarchtal, Oberstadion, Rechtenstein, Rottenacker, Untermarchtal, Unterstadion och Unterwachingen.[3]