1984 blev ElBaradei juridisk rådgivare vid IAEA:s sekretariat och 1993 blev han atomenergiorganets biträdande generaldirektör för externa förbindelser, innan han 1997 blev organets högste chef.
ElBaradei lämnade sin post som generaldirektör för IAEA i november 2009. Det har sedan dess spekulerats i huruvida han kommer att ställa upp i presidentvalet i Egypten 2011. Han har fått stöd från oppositionella i landet, men har själv sagt att han endast kan ställa upp om man genomför reformer för att garantera att valet blir fritt och demokratiskt. [1][2] ElBaradei återvände till Egypten 19 februari2010 och möttes av hundratals anhängare på flygplatsen i Kairo.[3]