Manitobasjön (på engelskaLake Manitoba, på franskalac Manitoba) är en sjö i Manitoba i Kanada, 4 623 km² stor.[2] Sjön är långsmal och flikig och endast 7 m djup. Den avrinner till Winnipegsjön.
Namnet kommer från creespråketsmanitou-wapow eller ojibwasmanitou-bah, som båda betyder "Manitous sund". Detta namn syftar på ett sund i sjöns mellersta del.